Tο εκκλησάκι του Άγιου Θωμά ανήκει στην απλή ,μονόκλιτη βασιλική με δίρρηκτη στέγη (παλιότερα η στέγη ήταν με κεραμίδια που αντικαταστάθηκαν από μπετόν μετά από επισκευή).Τα υλικά με τα οποία είναι κτισμένος ο ναός δεν είναι ορατά, όμως γύρω από το εκκλησάκι υπάρχει πλήθος αρχαίου και πρωτοχριστιανικού υλικού .
O ναός κτίστηκε γύρω στα μέσα του 18ου αιώνα και έχει υποστεί αρκετές επισκευές. Σύμφωνα με την παράδοση ο Άγιος Θωμάς ήταν μοναστήρι με αρκετούς μάλιστα μονάχους. H περιοχή λέγεται και Μπαλί η Κλήσα Μόσχου.
